การทำให้บริสุทธิ์ของเซลล์ประเภทนั้นขึ้นอยู่กับลักษณะนิสัยดั้งเดิมของเซลล์ใช้คุณสมบัติเช่นรูปร่างขนาดและความละเอียดที่สามารถวัดได้ซึ่งเป็นอุปกรณ์เดียวกับที่ใช้สำหรับการทำให้บริสุทธิ์ชนิดเซลล์โดยอ้างอิงจากแอนติบอดีและเครื่องหมายทางพันธุกรรม วิธีการใหม่นี้ทำให้สามารถเลือกชนิดเซลล์ได้โดยไม่ต้องอาศัยสิ่งมีชีวิตดัดแปลงพันธุกรรมแอนติบอดี้ที่มีจำหน่ายในท้องตลาด

ข้อมูลจากภายในและภายนอกเซลล์ ขั้นแรกนักวิจัยสร้างชุดข้อมูลโดยรวบรวมเซลล์เดียวจากอวัยวะหรือเนื้อเยื่อที่เลือก สำหรับแต่ละเซลล์เดียวจะวัดทั้งค่าดั้งเดิมของเซลล์และโปรไฟล์การแสดงออกของยีนเฉพาะของพวกเขาลักษณะที่พวกเขามองด้านใน จากนั้นนักวิจัยจะระบุชนิดของเซลล์ของแต่ละเซลล์ผ่านโปรไฟล์การแสดงออกของยีน คุณสมบัติดั้งเดิมนั้นจะถูกรวมเข้ากับชนิดของเซลล์ที่ระบุ ถัดไป GateID สามารถเลือกคุณสมบัติดั้งเดิมที่ดีที่สุดเพื่อชำระประเภทเซลล์ที่ต้องการในการทดลองครั้งต่อ ๆ ไป นักวิจัยแสดงให้เห็นว่า GateID ช่วยให้การแยกเซลล์หลายชนิดมีความบริสุทธิ์สูง